Die Fachschaftsräte (FSR) sind die studentischen Vertretungen an den einzelnen Fachbereichen. Parallel zu den Studierendenparlamentswahlen werden VertreterInnen für einen Fachschaftsrat gewählt. Am Stadtholz wird ein gemeinsamer FSR aus Studierenden der Bereiche Gesundheit und Mathematik gewählt. Der Bereich Ingenieurwissenschaften wählt einen eigenen FSR ohne Mathematik.

Der FSR vertritt die Studierenden eines Fachbereiches gegenüber dem Dekanat und knüpft Kontakte zu Fachschaften anderer Hochschulen. Er organisiert Infoveranstaltungen, Vollversammlungen und Protestaktionen und ist häufig Ausrichter traditioneller Parties. Daneben bieten viele Fachschaftsräte Klausurenservice und Lehrmittelverkauf an und betreiben Kopiergeräte an den Fachbereichen.

Die Fachschaftsräte sind Ansprechpartner für alle Probleme im Studium und stehen den Studierenden beratend zur Seite. Zu erreichen sind sie in der Regel während fester Büroöffnungszeiten (Aushänge beachten), per E-Mail oder telefonisch.